Mise à jour de la base de données ToxCast : un atout pour l'évaluation des perturbateurs endocriniens et l'outil CEHTRA
- Rim Kaidi
- il y a 15 heures
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L’identification des perturbateurs endocriniens (PE) est devenue un enjeu majeur de santé publique et environnementale au niveau mondial. Les PE sont des substances chimiques capables d’interférer avec le système hormonal, entraînant des effets délétères tant pour les humains que pour la faune. Le suivi et l’évaluation de ces substances sont essentiels pour protéger la santé des individus, en particulier des populations sensibles comme les femmes enceintes, les enfants, et les animaux sauvages. À cette fin, l’Agence de Protection de l’Environnement des États-Unis (EPA) a mis en place une base de données (ToxCast) sur l’activité biologique in vitro de plusieurs centaines de substances permettant d’analyser les effets endocriniens potentiels de ces substances.
Qu'est-ce que la base de données ToxCast ?
ToxCast (Toxicity Forecaster) est un programme phare mis en place par l’EPA pour évaluer les risques toxicologiques des substances chimiques. À travers un ensemble de tests de criblage in vitro à haut débit (HTS), ToxCast permet d'examiner la bioactivité de milliers de substances chimiques sur une série de cibles biologiques. Ces tests in vitro mesurent les effets biologiques, y compris les réponses hormonales, sur des récepteurs spécifiques, des enzymes et des processus cellulaires impliqués dans la régulation hormonale.
L’objectif principal de ToxCast est de fournir des informations précises sur les substances chimiques afin de prédire leur potentiel à interférer avec les systèmes biologiques, et notamment, à perturber les systèmes hormonaux humains et animaux. La base de données ToxCast contient des informations sur plus de 10 000 substances chimiques, ce qui en fait un outil inestimable pour les chercheurs et régulateurs travaillant à l’identification des PE.
L’un des grands avantages de ToxCast est qu’il repose sur des tests in vitro, ce qui réduit la nécessité de recourir à des essais sur des animaux. Cette approche contribue ainsi à la réduction de l’expérimentation animale, conformément aux objectifs de l'Union Européenne qui, dans le cadre de la stratégie "One Health", de la directive 2010/63/UE et de la feuille de route pour la sortie de l'expérimentation animale, cherche à promouvoir l'usage de méthodes alternatives pour l'évaluation de la toxicité, en favorisant les tests in vitro et les approches informatiques.
En quoi consiste cette mise à jour ?
La mise à jour la plus récente de ToxCast, invitrodb v4.3, apporte plusieurs améliorations cruciales, dont certaines sont directement destinées à renforcer les capacités d’évaluation des PE.
1. Amélioration de l'analyse des données
La mise à jour de la base de données ToxCast a introduit de nouvelles fonctionnalités permettant d'améliorer la précision de l’analyse des données de criblage. En effet, ces nouvelles méthodes d’analyse permettent de mieux interpréter les résultats obtenus à partir des tests in vitro. Les chercheurs bénéficient ainsi d’une capacité accrue à identifier les effets biologiques sur des récepteurs hormonaux et d’autres mécanismes clés influençant les systèmes endocriniens.
Les outils d’analyse ont été améliorés pour intégrer davantage de variables et faciliter les comparaisons entre différentes substances. Par exemple, les effets des produits chimiques sur les récepteurs hormonaux peuvent être comparés plus rapidement et avec une plus grande précision, permettant ainsi une identification précoce des substances suspectes de perturber le système hormonal.
2. Mise à jour des outils logiciels
Les outils logiciels utilisés pour analyser les données ToxCast ont également été mis à jour. Des packages R populaires, comme tcpl et tcplFit2, ont été améliorés pour offrir une meilleure gestion des données et des fonctionnalités de visualisation plus avancées. Ces outils permettent désormais de gérer de manière plus fluide les données de concentration-réponse, un aspect crucial dans l’évaluation de la toxicité des substances chimiques.
Le package tcplFit2, par exemple, améliore les ajustements des courbes dose-réponse et permet une estimation plus fiable des doses auxquelles les substances chimiques commencent à montrer des effets biologiques. Cela est essentiel pour évaluer les risques liés aux PE à des niveaux de concentration plus faibles, souvent rencontrés dans des environnements complexes.
3. Extension de la couverture des substances
La mise à jour de la base de données ToxCast a également permis d’ajouter de nouvelles substances chimiques à la base, portant ainsi le nombre total de substances chimiques évaluées à plus de 10 000. Cela permet une évaluation plus exhaustive des risques toxicologiques, y compris pour des substances moins courantes mais potentiellement dangereuses.
L'outil digital CEHTRA : une aide à l'identification des PE
L’une des avancées majeures dans l’utilisation des données ToxCast est l’outil digital CEHTRA, qui permet d’accéder facilement aux informations contenues dans la base de données ToxCast et de les analyser rapidement.
1. Vérification instantanée des substances
L'outil CEHTRA offre la possibilité de vérifier instantanément, grâce au numéro CAS, le statut réglementaire d’une substance chimique et sa présence dans des listes de PE potentiels ou avérés. En saisissant simplement le numéro CAS d’une substance, l’utilisateur peut obtenir des informations détaillées sur son statut, sa toxicité potentielle, et son historique d'évaluations réglementaires.
Cet outil apporte un gain de temps significatif, en accédant rapidement à des informations fiables sur les substances chimiques.
2. Analyse des données ToxCast
En plus de vérifier le statut réglementaire des substances, l’outil CEHTRA permet également d'analyser directement les données ToxCast relatives à ces substances. Il facilite ainsi l’exploitation des résultats des tests de criblage in vitro à haut débit pour évaluer la bioactivité des substances sur des cibles biologiques essentielles à la fonction endocrinienne. En quelques clics, les utilisateurs peuvent examiner l’ensemble des effets des substances chimiques sur des récepteurs hormonaux, des enzymes et d’autres processus biologiques.
Cet outil simplifie le traitement des données complexes de ToxCast, permettant aux utilisateurs de tirer rapidement des conclusions fiables concernant l’activité endocrinienne de ces substances. Cela est particulièrement utile pour les études sur les PE, où les données peuvent être diverses et difficilement identifiables sans outils adaptés.
Conclusion
La mise à jour de la base de données ToxCast représente une avancée importante dans l’évaluation des PE. Avec l’ajout de nouvelles substances, des améliorations dans l’analyse des données et une meilleure gestion des informations, cette mise à jour permet de disposer de données plus robustes pour évaluer les dangers potentiels des substances chimiques.
L’outil CEHTRA vient compléter cette mise à jour en offrant une plateforme numérique qui simplifie l’accès et l’analyse des données ToxCast. Grâce à ces innovations, l’identification rapide et fiable des PE devient plus accessible, ce qui renforce la capacité des acteurs du secteur à protéger la santé publique et l’environnement.
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